区人民政府（管委会）是本行政区域内违法建设治理的责任主体，负责统一领导、组织和协调辖区内的治理工作，其核心职责可概括为“五个负责”：
（一）负责统筹谋划。制定本辖区的违法建设治理工作计划或方案，明确街道办事处（乡镇人民政府）和所属相关部门的职责分工，并加强对各项工作落实情况的监督。
（二）负责巡查管控。督促街道办事处（乡镇人民政府）和相关部门建立并落实具体的巡查、发现、制止等管控措施，压实基层排查责任，确保早发现、早制止违法建设行为。
（三）负责组织实施。当事人逾期不履行自行拆除违法建设的决定时，负责责成或直接组织自然资源、城管、公安、乡镇（街道）等多个单位依法实施行政强制措施和强制拆除。
（四）负责经费保障。将违法建设治理工作所需经费纳入本级财政预算，为日常巡查、技术监测、强制拆除等行动提供坚实的资金保障，确保治理工作可持续开展。
（五）负责机制建设。建立“区、乡镇（街道）、村（社区）”三级巡查网格和快速处置响应工作机制，确保一旦发现违法建设苗头，能够迅速反应、有效处置，将问题解决在萌芽状态。