第四次全国农业普查的标准时点为2026年12月31日24时，时期资料为2026年年度资料。普查拟分四个阶段进行：
一是准备阶段（2025年—2026年）。主要是组建普查机构，研制普查方案，开展普查试点，落实普查经费和物资，开展普查宣传，选聘与培训普查人员，开展遥感测量，进行清查摸底等，为普查登记做好各项准备。
二是现场登记阶段（2027年1—5月）。主要是开展普查登记、数据上报、比对复查等工作。这是普查工作量最大、动员力量最多的阶段，也是普查工作中最为关键的环节。
三是数据处理及发布阶段（2027年6—12月）。主要是组织事后质量抽查，审核汇总并发布普查主要数据等。
四是资料开发应用阶段（2028年—2029年）。主要是建立普查数据库，编辑出版普查资料，开展分析研究等。